Yazar "Tekin, Kemal" seçeneğine göre listele

Listeleniyor 1 - 2 / 2
  • [ X ]
    Öğe
    Candida parapsilosis izolatlarının soğuk saklama koşullarına dayanıklılığı: On yıllık stoklama sonrası canlandırma
    (2020) Hoşbul, Tuğrul; Gümral, Ramazan; Bektöre, Bayhan; Tekin, Kemal; Şahiner, Fatih
    Amaç: Mikrobiyoloji laboratuvarlarında yürütülen araştırmalara farklı özelliklere sahip çok sayıdaki türün ve izolatın dâhil edilmesi çalışma verilerini değerli kılan önemli göstergelerden biridir. Bu amaçla her laboratuvar özgün bir suş koleksiyonu oluşturur. Bunun sürdürülebilirliği için tercih edilen saklama yöntemi izolatların uzun süreli saklanmasına ve hücrelerin canlı ve stabil kalmasına uygun olmalıdır. Bu çalışmada, Candida türlerinin soğukta saklama koşullarına olan dayanıklılıklarının tür düzeyinde incelenmesi amaçlanmıştır. Yöntem: Çalışmaya 10 yıldan daha uzun bir süredir laboratuvarımızda saklanan (-20°C’de boncuklu saklama tüpleri içerisinde) ve bu süre zarfında üzerlerinde herhangi bir canlandırma işlemi veya farklı bir çalışma yapılmayan, klinik örneklerden elde edilmiş 94 stok Candida izolatı dâhil edilmiştir. Çalışma örneklerinden sıvı ve katı besiyerlerine pasajlar alınarak canlanan suşların güncel rutin tanı yöntemleriyle doğrulaması yapılmıştır. Bulgular: Çalışma izolatlarında canlanma oranı Candida parapsilosis için %59.1 (13/22), Candida glabrata için %41.7 (5/12), Candida tropicalis için %25 (4/16) ve Candida albicans için %9.52 (4/42) olarak bulundu. C. parapsilosis izolatlarının canlı kalma oranı, C. albicans ve C. tropicalis izolatları ile karşılaştırıldığında istatistiksel olarak anlamlı derecede yüksek bulundu (sırasıyla p<0.0001 ve p=0.037). Sonuç: Bu çalışmada sunulan veriler yüksek sıcaklıklarda canlılığını sürdürebilen, soğuk koşullara adapte olan ve hastane ortamlarında uzun süre canlılığını sürdürebilen bir tür olan C. parapsilosis izolatlarının soğuk saklama koşullarına C. albicans başta olmak üzere C. tropicalis ve C. glabrata türlerinden daha dayanıklı olduğunu desteklemektedir.
  • Küçük Resim
    Öğe
    Maldi-Tof MS Analysis of Long-Term Stored Stock Candida Strains Identified by Molecular and Conventional Methods
    (2021) Hoşbul, Tuğrul; Şahiner, Fatih; Gümral, Ramazan; Kaya, Sinem; Bektöre, Bayhan; Tekin, Kemal; Yıldıran, Şinasi Taner
    Objective: In recent years, the rapid and accurate identification of Candida isolates at species level has been of great importance for reasons such as increased incidence of infections due to Candida species and differing antifungal susceptibilities by species. Herein, we aimed to investigate the efficacy of the MALDI-TOF MS method in the identification of Candida clinical isolates stored at-20 degrees C for years. Material and Method: Twenty eight Candida strains stored at-20 degrees C for more than 10 years without any recultivation and identified by various methods such as API (R) ID 32C, CHROMagar Candida and PCR-RFLP were included in the study. Isolates were subcultured and analysed by MALDI-TOF MS. An unidentified isolate at the species level previously and another isolate with low MALDI-TOF MS score were analyzed by ITS sequencing. Additionally, MALDI-TOF MS scores of 57 Candida strains isolated from routine cultures were compared with study isolates. Results: Of them, 11 (39.3%) isolates were identified at the species level and 15 (53.6%) were identified at the genus level, while two isolates were outside the reliable identification limits by MALDI-TOF MS. MALDI-TOF MS yielded an accurate identification at the species level in all 28 isolates identified by various methods even though different scores were obtained. Conclusion: MALDI-TOF MS is a cost effective, easy to use, fast and reliable method compared with the conventional and molecular methods for identification of stock Candida isolates preserved for many years. In conclusion, although a limited number of stock Candida isolates were included in the study, low identification scores for Candida isolates may be valuable in the MALDI-TOF MS analysis.