Yazar "Omay, İpek" seçeneğine göre listele

Listeleniyor 1 - 1 / 1
  • [ X ]
    Öğe
    2019-2021 Yılları Arasında Saptanan Viral Solunum Yolu Enfeksiyonu Etkenleri, COVID-19 ve Ko-Enfeksiyonlar
    (2023) Aydoğan, Sibel; Kırca, Füsun; Gozalan, Aysegul; Toyran, Alparslan; Başyiğit, Tuğcan; Omay, İpek; Dinc, Bedia
    Solunum yolu enfeksiyonları, her yaşta önemli morbidite ve mortalite nedeni olup tüm dünyada çok önemli bir halk sağlığı sorunu olarak görülmektedir. Bu çalışmada, pandemi öncesi bir yıllık dönemi de içine alan üç yıllık dönemde moleküler mikrobiyoloji laboratuvarında multipleks polimeraz zincir reaksiyonu [polymerase chain reaction (PCR)] testi ile çalışılan solunum yolu viral enfeksiyon etkenlerinin, viral koenfeksiyonların ve Koronavirüs hastalığı-2019 [Coronavirus disease-2019 (COVID-19)] ile birlikteliklerinin analizini yaparak pandeminin, etkenlerin epidemiyolojik ve mevsimsel özellikleri üzerine olan etkisinin değerlendirilmesi amaçlanmıştır. Mart 2019-Aralık 2021 tarihleri arasında moleküler mikrobiyoloji laboratuvarına solunum yolları multipleks PCR test istemiyle kabul edilen 8825 solunum yolu örneği çalışmaya alınmıştır. Ayrıca solunum yolları multipleks PCR testiyle pozitif sonuç alınmış hastaların ± 3 gün içinde çalışılmış şiddetli akut solunum yolu sendromu koronavirüs-2 [severe acute respiratory syndrome coronavirus-2 (SARS-CoV-2)] PCR testi sonuçları retrospektif olarak değerlendirilmiştir. Solunum yolu viral patojenleri “FTD Respiratory Pathogens 21 kit (Fast Tract Diagnostics, Siemens Healthineers, Almanya)” ile çalışılarak tespit edilmiştir. SARS-CoV-2 RNA saptanması için farklı dönemlerde gerçek zamanlı revers transkriptaz PCR esaslı iki ayrı kit kullanılmıştır. Çalışmada elde edilen bulgulara göre, 8825 örneğin 2156 (%24.4)’sında en az bir viral etken ve bunların 1843 (%85.5)’ünde tek etken saptanmıştır. Tek etken saptanan örneklerdeki virüslerin dağılımı sıklık sırasına göre RV, RSV A/B, HCoVs, AdV, flu A virüsü, MPV A/B, PIV 1-4, flu B virüsü, EV, BoV ve PeV olarak belirlenmiştir. Etken saptanan 2156 hasta örneğinin 313 (%14.5) tanesinde çoklu etken bulunmuştur. Bunlar; 291 örnekte iki, 21 örnekte üç ve bir örnekte dört etken olarak görülmüştür. En sık saptanan kombinasyonlar AdV + RV, AdV + EV, EV + RV, RV + HCoVs, RSV A/B + RV olarak saptanmıştır. Solunum yolları multipleks PCR ile pozitif sonuç alınmış hastaların ± 3 gün içinde çalışılmış SARS-CoV-2 PCR test sonuçları retrospektif olarak değerlendirildiğinde, en az bir etken saptanmış 1277 örneğin 45 (%3.5)’inde SARS-CoV-2 RNA tespit edilmiştir. Bu hastaların dört tanesinde SARS-CoV-2 çoklu etkenlerle birlikte bulunmuştur. Sonuç olarak, pandemi döneminde tüm viral etkenlerin prevalansında keskin bir azalma görülmüştür. Bu duruma, COVID-19 enfeksiyonunun yanı sıra pandemi döneminde uygulanan kısıtlamaların da etkili olduğu düşünülmüştür.