Yazar "Gozalan, Aysegul" seçeneğine göre listele

Listeleniyor 1 - 6 / 6
  • [ X ]
    Öğe
    2019-2021 Yılları Arasında Saptanan Viral Solunum Yolu Enfeksiyonu Etkenleri, COVID-19 ve Ko-Enfeksiyonlar
    (2023) Aydoğan, Sibel; Kırca, Füsun; Gozalan, Aysegul; Toyran, Alparslan; Başyiğit, Tuğcan; Omay, İpek; Dinc, Bedia
    Solunum yolu enfeksiyonları, her yaşta önemli morbidite ve mortalite nedeni olup tüm dünyada çok önemli bir halk sağlığı sorunu olarak görülmektedir. Bu çalışmada, pandemi öncesi bir yıllık dönemi de içine alan üç yıllık dönemde moleküler mikrobiyoloji laboratuvarında multipleks polimeraz zincir reaksiyonu [polymerase chain reaction (PCR)] testi ile çalışılan solunum yolu viral enfeksiyon etkenlerinin, viral koenfeksiyonların ve Koronavirüs hastalığı-2019 [Coronavirus disease-2019 (COVID-19)] ile birlikteliklerinin analizini yaparak pandeminin, etkenlerin epidemiyolojik ve mevsimsel özellikleri üzerine olan etkisinin değerlendirilmesi amaçlanmıştır. Mart 2019-Aralık 2021 tarihleri arasında moleküler mikrobiyoloji laboratuvarına solunum yolları multipleks PCR test istemiyle kabul edilen 8825 solunum yolu örneği çalışmaya alınmıştır. Ayrıca solunum yolları multipleks PCR testiyle pozitif sonuç alınmış hastaların ± 3 gün içinde çalışılmış şiddetli akut solunum yolu sendromu koronavirüs-2 [severe acute respiratory syndrome coronavirus-2 (SARS-CoV-2)] PCR testi sonuçları retrospektif olarak değerlendirilmiştir. Solunum yolu viral patojenleri “FTD Respiratory Pathogens 21 kit (Fast Tract Diagnostics, Siemens Healthineers, Almanya)” ile çalışılarak tespit edilmiştir. SARS-CoV-2 RNA saptanması için farklı dönemlerde gerçek zamanlı revers transkriptaz PCR esaslı iki ayrı kit kullanılmıştır. Çalışmada elde edilen bulgulara göre, 8825 örneğin 2156 (%24.4)’sında en az bir viral etken ve bunların 1843 (%85.5)’ünde tek etken saptanmıştır. Tek etken saptanan örneklerdeki virüslerin dağılımı sıklık sırasına göre RV, RSV A/B, HCoVs, AdV, flu A virüsü, MPV A/B, PIV 1-4, flu B virüsü, EV, BoV ve PeV olarak belirlenmiştir. Etken saptanan 2156 hasta örneğinin 313 (%14.5) tanesinde çoklu etken bulunmuştur. Bunlar; 291 örnekte iki, 21 örnekte üç ve bir örnekte dört etken olarak görülmüştür. En sık saptanan kombinasyonlar AdV + RV, AdV + EV, EV + RV, RV + HCoVs, RSV A/B + RV olarak saptanmıştır. Solunum yolları multipleks PCR ile pozitif sonuç alınmış hastaların ± 3 gün içinde çalışılmış SARS-CoV-2 PCR test sonuçları retrospektif olarak değerlendirildiğinde, en az bir etken saptanmış 1277 örneğin 45 (%3.5)’inde SARS-CoV-2 RNA tespit edilmiştir. Bu hastaların dört tanesinde SARS-CoV-2 çoklu etkenlerle birlikte bulunmuştur. Sonuç olarak, pandemi döneminde tüm viral etkenlerin prevalansında keskin bir azalma görülmüştür. Bu duruma, COVID-19 enfeksiyonunun yanı sıra pandemi döneminde uygulanan kısıtlamaların da etkili olduğu düşünülmüştür.
  • [ X ]
    Öğe
    Epidemiology of hepatitis B, hepatitis C, and syphilis co-infections in HIV-1 patients: a retrospective cross-sectional study of prevalence and viral load correlates
    (K Faisal Spec Hosp Res Centre, 2025) Aydogan, Sibel; Kirca, Fusun; Gozalan, Aysegul; Aslan, Ferhat Gurkan; Gurler, Merve; Toyran, Alparslan; Dinc, Bedia
    BACKGROUND: Co-infections with hepatitis B (HBV), hepatitis C (HCV) and syphilis complicate the clinical management of people living with HIV by influencing disease progression, treatment response, and transmission risk. Despite the growing HIV burden in T & uuml;rkiye, data on the impact of these coinfections remain limited. OBJECTIVES: To determine the prevalence of HBV, HCV, and syphilis coinfections in adults with HIV-1 and to examine their associations with demographics and HIV-1 viral load. DESIGN: Retrospective cross-sectional study SETTING: Single center, tertiary care hospital in T & uuml;rkiye PATIENTS AND METHODS: Adults diagnosed with HIV-1 between March 2019 and June 2024 at Ankara Bilkent City Hospital were included. Demographic information, HIV viral load measurements, and serological and molecular test results for HBV, HCV, and syphilis were retrieved from the institutional laboratory database. Coinfection status was assessed relative to age, gender, and HIV viral load. MAIN OUTCOME MEASURES: Prevalence and distribution of HBV, HCV, and syphilis coinfections and their associations with demographic variables and HIV viral load. SAMPLE SIZE: 724 patients RESULTS: The study population was predominantly male (86%), with a median age of 40 years. Syphilis was the most common coinfection (25.6%), followed by HBV at 4.1% and HCV at 1.8%. Syphilis was significantly more prevalent among men (P=.001), and HBV coinfection was associated with older age (P=.005). No significant associations were observed between HIV viral load and any co-infection. Notably, a substantial proportion of patients, especially those newly diagnosed after 2019, had high HIV RNA levels, suggesting delayed diagnosis and treatment initiation. Triple coinfections were rare but remain clinically relevant. CONCLUSIONS: The high prevalence of syphilis and delayed HIV diagnoses highlight the urgent need for improved screening protocols, timely initiation of antiretroviral therapy, and broader implementation of HBV vaccination programs. An integrated multisectoral approach is critical to address the overlapping clinical and public health burdens posed by these co-infections. Healthcare strategies must consider the impact of COVID-19-related service disruptions, which likely contributed to delays in diagnosis and treatment. LIMITATIONS: Lack of data on patients' behavioral risk factors and no follow-up on treatment outcomes for syphilis
  • [ X ]
    Öğe
    Impact of non-pharmaceutical interventions on circulating respiratory viruses during the COVID-19 pandemic in Turkey
    (K Faisal Spec Hosp Res Centre, 2023) Kirca, Fusun; Aydogan, Sibel; Gozalan, Aysegul; Guler, Ezgi; Erten, Aysegul Zehra Uyan; Uygur, Ayse Sena Ozsen; Dogan, Alper
    BACKGROUND: Non-pharmaceutical interventions (NPIs) applied to limit the SARS-CoV-2 pandemic also affect the circulation and seasonal characteristics of other respiratory viruses.OBJECTIVES: Assess the impact of NPIs on the spread and seasonal characteristics of non-SARS-CoV-2 respiratory viruses and examine viral respiratory co-infections.DESIGN: Retrospective cohortSETTING: Single center in Turkey.PATIENTS AND METHODS: Syndromic multiplex viral polymerase chain reaction (mPCR) panel results of patients admitted to the Ankara Bilkent City Hospital with symptoms of acute respiratory tract infec-tion between April 1, 2020 and October 30, 2022 were evaluated. Two study periods before and after 1 July 2021, when the restrictions were discontinued, were statistically analyzed and compared to determine the effect of NPIs on circulating respiratory viruses.MAIN OUTCOME MEASURES: Prevalence of respiratory viruses as determined by syndromic mPCR panel.SAMPLE SIZE: 11 300 patient samples were evaluated.RESULTS: At least one respiratory tract virus was detected in 6250 (55.3%) patients. Of these, at least one respiratory virus was detected in 5% in the first period (between April 1, 2020 and June 30, 2021, when NPIs were applied), and in 95% in the second period (between July 1, 2021 and October 30, 2022, when NPIs were relaxed). After the removal of NPIs, there was a statistically significant increase in hRV/EV, RSV-A/B, Flu A/H3, hBoV, hMPV, PIV-1, PIV-4, hCoV-OC43, PIV-2 and hCoV-NL63 (P<.05). In the 2020-2021 season, when strict NPIs were applied, all respiratory viruses evaluated did not have the usual sea-sonal peak and there were no seasonal influenza epidemics during this period.CONCLUSIONS: NPIs resulted in a dramatic decrease in the preva-lence of respiratory viruses and notable disruption of seasonal charac-teristics.LIMITATIONS: Single-center study and retrospective.CONFLICT OF INTEREST: None.
  • [ X ]
    Öğe
    Molecular Characterization of Carbapenem-Resistant Acinetobacter baumannii Blood Culture Isolates from Three Hospitals in Turkey
    (Natl Inst Infectious Diseases, 2021) Gozalan, Aysegul; Unaldi, Ozlem; Guldemir, Dilek; Aydogan, Sibel; Kuzucu, Cigdem; Cakirlar, Fatma Koksal; Acikgoz, Ziya Cibali
    We aimed to investigate the clonal relationships, common sequence types, and carbapenemase genes in 177 non-repetitive blood culture isolates of Acinetobacter baumannii collected from patients at three university hospitals in Turkey in 2016. Molecular epidemiological characteristics of the isolates were examined using pulsed-field gel electrophoresis (PFGE), and multilocus sequence typing (MLST) (Pasteur scheme-cpn60, fusA, gltA, pyrG, recA, rplB, and rpoB). Multiplex PCR was used to investigate the carbapenemase genes, including bla(OXA-23-like),bla(OXA-24-like), bla(OXA-48-like), bla(OXA-58-like), bla(IMP), bla(VIM) and bla(NDm). PFGE genotyping yielded 92 pulsotypes with a clustering ratio of 69.7%. As per a >= 85% similarity coefficient, 159 (90.9%) isolates were found to be clonally related. The bla(OXA-)(23-like) and bla(OXA-)(58)-like genes were identified in 100% and 28.2% of the isolates, respectively. The bla(NDM) gene was identified in two isolates. The MLST analysis included 54 isolates with different pulsotypes, and 29 sequence types (STs). Most of the isolates (n = 36) belonged to the clonal complex (CC)2, one isolate belonged to CC1, and one isolate belonged to CC164. Sixteen new STs (ST1235-ST1250) were identified. Identifying both global ST2 and a large number of new STs, revealed high genetic diversity in A. baumannii isolates in the study population.
  • [ X ]
    Öğe
    West Nile virus seropositivity in Alanya, a coastal city in the Mediterranean region of Turkey
    (K Faisal Spec Hosp Res Centre, 2024) Bektore, Bayhan; Dogan, Bora; Ozkul, Akyut; Gozalan, Aysegul
    BACKGROUND: West Nile virus (WNV)-related illness is a global health problem. Understanding the seropositivity rates and identifying the risk factors related to WNV in various animal species including humans is crucial for the implementation of effective prevention strategies. OBJECTIVES: Assess the rate of seropositivity and the risk factors as-sociated with WNV seropositivity .DESIGN: Descriptive, cross-sectional SETTING: Microbiology and virology departments in a veterinary college PATIENTS AND METHODS: In a sample of healthy human participants in Alanya, located close to regions where WNV activity has been detected, anti-WNV IgG antibody detection was performed using enzyme-linked immunosorbent assays. The positive results were con-firmed by virus neutralization tests (VNTs). The sample was compared with a second group of age- and gender-matched healthy subjects selected from a previous cross-sectional study. MAIN OUTCOME MEASURES: Determination of the seropositivity and risk factors that were associated with WNV in healthy humans. SAMPLE SIZE: 87 in current study; 356 in previous study. RESULTS: The first group of 87, which had a high risk of encountering vector mosquitoes, had a positivity rate of 8% (7/87), whereas positivity in the second group was 4.5% (16/356; P=.181). In the entire sample, the anti-WNV IgG antibody was positive in 23 out of 443 (5.2%) sam-ples by the ELISA test. Among these 23 samples, ten were confirmed as positive using VNTs. Therefore, the WNV IgG seropositivity was 2.3% (10/442). Confirmed IgG seropositivity rates were higher among male (3.8%) than female participants (0.9%; P=.054) and among adults aged >= 45 years (4%) than those aged 18-44 years (0.8%; P=.048). CONCLUSION: This study highlights the presence of WNV infection in the research region. More comprehensive and multidisciplinary studies are required to increase our knowledge about this zoonotic infection including risk factors in line with the One Health approach LIMITATIONS: Small sample size.
  • [ X ]
    Öğe
    Yoğun bakım ünitelerinde kan dolaşımı enfeksiyonu etkeni karbapenem dirençli Acinetobacter baumannii izolatlarının moleküler yöntemlerle karakterizasyonu
    (T.C. Sağlık Bakanlığı Halk Sağlığı Genel Müdürlüğü, 2020) Gozalan, Aysegul; Ünaldı, Özlem; Kıırca, Fisun; Çöplü, Nilay; Muderris, Tuba; Acikgoz, Ziya Cibali; Durmaz, Rıza
    Amaç: Bu çalışmada; yoğun bakım ünitelerinde takip edilen hastaların kan örneklerinden izole edilen karbapenem dirençli Acinetobacter baumannii izolatları arasındaki klonal ilişki ve karbapenem direnç genlerinin moleküler yöntemler ile araştırılması amaçlandı. Yöntem: Kan kültürü şişelerinden bakteri izolasyonu için Bactec 9240 sistemi Becton Dickinson, ABD kullanıldı. Çalışmaya; konvansiyonel testler, API 20NE bioMèrieux, Fransa ve Phoenix TM 100 sistemi Becton Dickinson, ABD ile tanımlanan ve blaOXA-51 gen varlığı gösterilerek doğrulanan 112 A. baumannii suşu dahil edildi. Antimikrobiyal duyarlılık testleri Kirby-Bauer disk difüzyon yöntemi ve Phoenix TM 100 sistemi ile gerçekleştirildi. Karbapenem direnç genleri; blaOXA-23, blaOXA-48, blaOXA-58, blaIMP, blaVIM ve blaNDM-1 Multipleks Polimeraz Zincir Reaksiyonu PZR yöntemi ile araştırıldı. Acinetobacter baumannii suşları arasındaki klonal ilişkinin belirlenmesi için Pulse Field Jel Elektroforezi PFGE yöntemi kullanıldı. Bulgular: Suşların antibiyotik direnç yüzdeleri gentamisin, amikasin, tobramisin, netilmisin, seftazidim, trimetoprim/sulfametoksazol, piperasilin, siprofloksasin, ampisilin/sulbaktam, piperasilin/ tazobaktam ve sefoperazon/sulbaktam için sırasıyla %88; %81; %78; %36; %98,5; %96; %89; %100; %100; %93; %91 olarak bulundu. İmipenem ve meropenem MİK değerleri tüm grupta ?8 µg/mL’nin üzerinde saptandı. Çalışmaya alınan izolatların tümünde blaOXA-51 ve blaOXA-23 gen varlığı tespit edildi. PFGE yöntemi ile 62 farklı pulsotip saptandı. Pulsotiplerden 19 tanesi birbiriyle ayırt edilemez profil gösteren eşittir üzeri ?2 suş içermekteydi. Toplam 108 %96,4 suşun benzerlik oranı pulsotipler için %85 ve üzeri kabul edildiği durumda klonal yönden ilişkili 11 grup içerisinde toplandıkları gözlendi. Sonuç: Bu çalışmada, karbapenem dirençli A. baumannii suşlarının netilmisin dışında çalışılan tüm antibiyotiklere çok yüksek yüzdelerle dirence sahip olduğu ve hastane içinde çapraz bulaş yoluyla yayıldığı gösterildi. Bu suşlar hastane enfeksiyonları açısından risk oluşturmaktadır, bunula birlikte klonal yönden ilişkili suşlar spesifik bir ünite ve zaman periyodu ile sınırlı değildir.