Candida parapsilosis izolatlarının soğuk saklama koşullarına dayanıklılığı: On yıllık stoklama sonrası canlandırma

Abstract

Amaç: Mikrobiyoloji laboratuvarlarında yürütülen araştırmalara farklı özelliklere sahip çok sayıdaki türün ve izolatın dâhil edilmesi çalışma verilerini değerli kılan önemli göstergelerden biridir. Bu amaçla her laboratuvar özgün bir suş koleksiyonu oluşturur. Bunun sürdürülebilirliği için tercih edilen saklama yöntemi izolatların uzun süreli saklanmasına ve hücrelerin canlı ve stabil kalmasına uygun olmalıdır. Bu çalışmada, Candida türlerinin soğukta saklama koşullarına olan dayanıklılıklarının tür düzeyinde incelenmesi amaçlanmıştır. Yöntem: Çalışmaya 10 yıldan daha uzun bir süredir laboratuvarımızda saklanan (-20°C’de boncuklu saklama tüpleri içerisinde) ve bu süre zarfında üzerlerinde herhangi bir canlandırma işlemi veya farklı bir çalışma yapılmayan, klinik örneklerden elde edilmiş 94 stok Candida izolatı dâhil edilmiştir. Çalışma örneklerinden sıvı ve katı besiyerlerine pasajlar alınarak canlanan suşların güncel rutin tanı yöntemleriyle doğrulaması yapılmıştır. Bulgular: Çalışma izolatlarında canlanma oranı Candida parapsilosis için %59.1 (13/22), Candida glabrata için %41.7 (5/12), Candida tropicalis için %25 (4/16) ve Candida albicans için %9.52 (4/42) olarak bulundu. C. parapsilosis izolatlarının canlı kalma oranı, C. albicans ve C. tropicalis izolatları ile karşılaştırıldığında istatistiksel olarak anlamlı derecede yüksek bulundu (sırasıyla p<0.0001 ve p=0.037). Sonuç: Bu çalışmada sunulan veriler yüksek sıcaklıklarda canlılığını sürdürebilen, soğuk koşullara adapte olan ve hastane ortamlarında uzun süre canlılığını sürdürebilen bir tür olan C. parapsilosis izolatlarının soğuk saklama koşullarına C. albicans başta olmak üzere C. tropicalis ve C. glabrata türlerinden daha dayanıklı olduğunu desteklemektedir.

Objective: Studies conducted in microbiology laboratories with the inclusion of huge amount and variety of species and isolates are important indicators that render them valuable. For this purpose, each laboratory creates its own unique strain collection. For the sustainability of this procedure, the preferred storage method should be suitable for long-term storage of the isolates that keep the cells alive and stable. In this study, it was aimed to investigate the viability of Candida species in cold storage conditions at species level. Method: The study included 94 stocks of Candida isolates obtained from clinical samples that had been stored in our laboratory for more than 10 years (in Cryobank vials with beads at -20°C) and had not undergone any recultivation or other recovery procedures during this period. Samples were passaged into liquid and solid media and recovered strains were confirmed with current routine diagnostic methods. Results: The recovery rate of the study isolates was found 59.1% (13/22) for Candida parapsilosis, 41.7% (5/12) for Candida glabrata, 25% (4/16) for Candida tropicalis, and 9.52% (4/42) for Candida albicans. The recovery rate of C. parapsilosis isolates was found to be significantly higher compared to C. albicans and C. tropicalis isolates (p<0.0001 and p=0.037, respectively). Conclusion: The data presented in this study support that C. parapsilosis isolates, which can survive at high temperatures, adapt to cold conditions and survive in hospital environments. They are also more stable under cold storage conditions than C. tropicalis C. glabrata, and especially C. albicans species.